可以通过修改闪烁晶体的化学成分来定制闪烁晶体，以提高其在特定应用中的性能。例如，引入少量掺杂剂可以增强晶体的光输出，如铊掺杂的碘化钠 (NaI(Tl)) 和碘化铯 (CsI(Tl))。此外，某些掺杂剂可以影响闪烁过程的衰减时间，例如钇掺杂的氟化钡 (BaF₂-Y)。多种元素共掺杂可以进一步调整能量响应并提高闪烁效率，例如钙共掺杂的 LYSO(Ce) (LYSO(Ca, Ce))。

表面处理包括切割、研磨、抛光和涂层，可用于晶体以减少光散射、提高光收集效率并实现良好的均匀性和能量分辨率。例如，可以使用不同等级的砂纸（如 W14 和 W28）将定制的闪烁晶体研磨成特定的颗粒大小（以微米为单位）。此外，可以使用 T0285 进行机械抛光以增加到达光传感器的光子数量。

反射材料，包括 BaSO4 、TiO₂、 E60 、ESR、特氟龙等。 应用于单个闪烁晶体时可显著提高光收集效率。这些反射器还可用于像素化晶体，以减少相邻像素之间的串扰。例如，BaSO₄和ESR通常与LYSO(Ce)和BGO一起用于PET/SPECT应用，而TiO₂则用于CsI(Tl)、CdWO₄和GOS，用于工业CT和X射线安全检查。

闪烁晶体可通过专门的封装进行定制，以提高其性能并保护其免受湿度、温度、冲击和振动等环境因素的影响。例如，NaI(Tl)、LaBr₃(Ce) 和 CeBr₃ 等吸湿性材料都需要铝制外壳和光学窗口来防潮。